Эффективность работы специализированных ТТС достигается при технологическом соответствии и оптимальном сочетании подсистем груз — судно — порт. Любая диспропорция в развитии указанных подсистем приводит к потерям провозной способности флота или пропускной способности портов, а также к значительным трудностям в организации транспортного процесса.

Организация линейных перевозок с использованием специализированных ТТС требует создания в портах высокопроизводительных комплексов, обеспечивающих обработку судов с высокой интенсивностью. Основные линии, на которых эксплуатируются контейнеровозы, суда с горизонтальной погрузкой и лихте-ровозы, замыкаются на хорошо оснащенные портовые комплексы.

Суда с горизонтальной погрузкой обрабатывают на специализированных причалах, построенных как самостоятельные комплексы или как составные элементы крупных терминалов, рассчитанных на обработку всех типов специализированных судов, осуществляющих перевозку генеральных грузов укрупненными местами.В зависимости от специализации ТТС существующие портовые комплексы можно разделить на три группы. В первую группу входят комплексы для перегрузки крупнотоннажных контейнеров с автоматизированными грузовыми системами, частично автоматизированными и неавтоматизированными. Во вторую группу входят комплексы для обработки различных типов судов с горизонтальной погрузкой: универсальных судов с горизонтальной погрузкой; судов-пакетовозов с использованием автоматизированных складов; судов-автомобилевозов; судов-паромов (морских и океанских). Третью группу составляют комплексы для обслуживания лихтеровозной системы: рейдовые причалы; береговые причалы выносного типа; причалы для обработки лихтеров.